Next-Generation Sequencing

Erstellung von Transkriptom-Profilen und parallele Detektion von Oberflächenproteinen auf Einzelzellebene

Anwendungsbeispiel:

• Funktionskontrolle therapeutischer CARs (zum Beispiel CAR-T-Zellen, CAR-NK-Zellen) und Monitoring des Therapieerfolgs in Patient*innenproben (Rade et al. *)

Verfügbare Assays:

• Assays für die Analyse des  kompletten Transkriptoms:
  • GEM-X Universal 3' Gene Expression – optional in Kombination mit ATAC-Seq
  • GEM-X Universal 5‘ Gene Expression– optional in Kombination mit Single Cell Immune Profiling
    • T-Zell- und / oder B-Zell Rezeptoranalyse
    • Analyse benutzerdefinierter Oberflächenproteine
• Sonden-basierter Assay für kodierende Bereiche des Transkriptoms:
  • Flex Gene Expression – optional in Kombination mit der Analyse von CAR-Konstrukten oder eigenen Targets (benutzerdefiniertes Sondendesign)

* Rade M, Grieb N, Weiss R, et al. Single-cell multiomic dissection of response and resistance to chimeric antigen receptor T cells against BCMA in relapsed multiple myeloma. Nat Cancer. 2024 Sep;5(9):1318-1333. doi: 10.1038/s43018-024-00763-8

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