Bioinformatik

© Fraunhofer IZI

Das Ziel der Arbeitsgruppe Bioinformatik sind frühzeitige Diagnosen sowie verbesserte Risikostratifizierungen für die personalisierte Medizin, um eine an Patient*innen individuell angepasste Therapiewahl zu ermöglichen. Hier setzen wir mit computergestützten Methoden kombiniert mit omic-weiten und multi-modalen analytischen Verfahren an.

Ein breites Spektrum an Methoden ermöglicht es uns, gemeinsam mit Ihnen eine angepasste Lösung für Ihre Herausforderung in der Präzisionsmedizin umzusetzen:

  • Wir begleiten Sie bei der Entwicklung von Algorithmen und Klassifikationsmodellen für In-Vitro-Diagnostika.
  • Für neuartige Arzneimittel, wie Gen- und Zelltherapien, unterstützen wir Sie, detaillierte Einblicke in Wirk- und Resistenzmechanismen zu erhalten.
  • Bei klinischen Studien sind wir Ihr Partner für eine begleitende Bewertung der Behandlungsergebnisse unter Verwendung von omic-weiten und multi-modalen Messungen.
  • Bei Bedarf begleiten wir Sie bei der Implementierung der resultierenden Biomarkersignatur als Software-Prototyp für Medizinprodukte (zum Beispiel als In-Vitro-Diagnostikum).
  • Unsere Entwicklungsprozesse setzen wir im Rahmen eines zertifizierten Qualitätsmanagementsystems (ISO 9001:2015) um.
  • Der Software-Lebenszyklus wird gemäß IEC 62304 geplant und gelenkt sowie unter Beachtung des Risikomanagements gemäß ISO 14971 durchgeführt. 

In Kooperation mit der Arbeitsgruppe Next-Generation Diagnostics sowie der Technologieplattform Advanced Analytics setzen wir multi-modale Messungen für die Präzisionsmedizin um.

Methoden

  • Maschinelles Lernen
  • Statistisches Lernen
  • KI 
  • Bioinformatik
  • Multi-modale Analysen 
  • Integrative Bioinformatik 
  • Computational Biology
  • Functional Genomics
Darstellung der verschiedenen Ebenen der molekularen Charakterisierung von Gewebeproben (v.l.n.r): Zusammensetzung des ursprünglichen Gewebes (verschiedene Zellpopulationen sind in verschiedenen Farben dargestellt), Sequenzierung eines Zellgemisches (bulk transcriptomics), Sequenzierung einzelner Zellen (single-cell sequencing) und räumlich aufgelöste Sequenzierung (spatial transcriptomics).
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Darstellung der verschiedenen Ebenen der molekularen Charakterisierung von Gewebeproben (v.l.n.r): Zusammensetzung des ursprünglichen Gewebes (verschiedene Zellpopulationen sind in verschiedenen Farben dargestellt), Sequenzierung eines Zellgemisches (bulk transcriptomics), Sequenzierung einzelner Zellen (single-cell sequencing) und räumlich aufgelöste Sequenzierung (spatial transcriptomics).