Next-Generation Sequencing

Zur Kontrolle von Quantität, Qualität und Integrität von RNA- und DNA-Proben, welche aus verschiedensten Ausgangsmaterialien isoliert werden können, stehen folgende Geräte zur Verfügung:

• Fluorometer (Qubit und DeNovix)
• Nanodrop 1000
• BioAnalyzer
• LightCycler® 480

Zur Durchführung von Next-Generation Sequenzierungen stehen drei verschiedene Geräte zur Verfügung. Diese Geräte erlauben je nach experimentellen Anforderungen eine flexible Probenanzahl, sowie einen skalierbaren Datenoutput.

• NextSeq 2000 (Illumina)
• MiSeq (Illumina)
• MinION (Oxford Nanopore Technologies)

Für die Datenauswertung besitzt das Institut ein eigenes

• High Performance Computing Cluster

Für die Zellvereinzelung und das Barcoding und den Gewebetransfer nutzen wir die Plattformen von 10x Genomics:

• 10x Chromium Controller
• 10x Genomics Chromium Controller iX
• 10x CytAssist

• LUNA Automated Cell Counter
• Rotationsmikrotom