RIBOLUTION Biomarker Center

Wir sind ihr Partner für:

• die Entwicklung von Algorithmen und Klassifizierungsmodellen für die In-vitro-Diagnostik.
• die Gewinnung detaillierter Einblicke in die Wirkungs- und Resistenzmechanismen neuartiger Medikamente, wie zum Beispiel Gen- und Zelltherapien, durch die Nutzung der Einzelzellanalytik.
• die begleitende Auswertung von Behandlungsergebnissen für klinische Studien unter Verwendung von omics-weiten und multimodalen Messungen.
• die Umsetzung der resultierenden Biomarker-Signatur als Software-Prototyp für medizinische Geräte (zum Beispiel als Software für In-vitro-Diagnostik).

Klassische NGS-Methoden

• Vollständige Transkriptomsequenzierung (mRNA, totalRNA): Erstellung von Genexpressionsprofilen für biologische und / oder medizinische Fragestellungen (zum Beispiel Krebserkrankungen, seltene Syndrome) sowie translationale Forschung
• Amplikon-basierte Sequenzierung: Sequenzierung ausgewählter genomischer Regionen für die Präzisionsonkologie sowie Testung auf Erbkrankheiten
• Genomsequenzierung / Exomsequenzierung: Genomprofilierung für Studien zu Krebserkrankungen sowie translationale Forschung
• Sequenzierung kleiner Genome: Gezielte oder vollständige Sequenzierung von Genomen mit geringer Komplexität (wie Bakterien, Viren oder Phagen)

Fortgeschrittene NGS-Methoden

• Einzelzellsequenzierung und Multiomics: Transkriptomprofile und parallele Detektion von Oberflächenproteinen einzelner Zellen. Beispielsweise zur Funktionskontrolle therapeutischer CARs (zum Beispiel CAR-T-Zellen, CAR-NK-Zellen) und zum Monitoring des Therapieerfolges in Patient*innen.
• Räumliche Sequenzierung (spatial transciptomics): Räumlich aufgelöste Genexpressionsprofile in Geweben nahe der Einzelzellauflösung, beispielsweise für eine parallele molekulare und bildgebende Charakterisierung von Tumor, tumorinfiltrierenden Immunzellen und Tumormikroumgebung
  

Medizinische Biofinformatik

• Maschinelles Lernen & Multi-Omics: Maschinelles Lernen und KI für Deep Molecular Data; multimodale Datenauswertung; Statistisches Lernen; Integrative Bioinformatik; Pipeline-Entwicklung; Power-Analyse
• Softwarekomponenten für IVDs: Entwicklung von Algorithmen und Software-Komponenten für medizinische Geräte insbesondere In-vitro-Diagnostika (IVDs) und im Labor entwickelte Tests (LDTs – Lab Developed Tests)

Qualitätssicherung

• ISO 9001 zertifiziertes Qualitätsmanagement System
• NGS und Bioinformatik gemäß etablierter SOPs
• Softwareentwicklung für medizinische Geräte und In-vitro-Diagnostika nach IEC 62304, ISO 14971
• DSGVO-konforme Datenverarbeitung

Technische Ausstattung

• NextSeq 2000, Illumina
• MiSeq, Illumina
• MinION, Oxford Nanopore Technologies
• 10x Chromium Controller
• LUNA Automated Cell Counter
• High Performance Computing Cluster
• Weitere fortschrittliche Technologien sind verfügbar