Next-Generation Sequencing

Gemeinsam mit unseren Partnern führen wir Projekte im Bereich Sequenzierung, Immunonkologie und Infektionspathologie durch.

Wir sind nach DIN EN ISO 9001 zertifiziert und arbeiten nach etablierten SOPs. In unseren Forschungsprojekten setzen wir individuelle Lösungen um und erweitern unser Methodenspektrum.

Die CAR-T-Zelltherapie eröffnet neue Möglichkeiten für die Behandlung von Tumoren. Dabei werden die Immunzellen der Patient*innen mit einem künstlichen Rezeptor ausgestattet, der es ermöglicht, Krebszellen zu erkennen und gezielt zu eliminieren.

Im Rahmen des Projekts KI-CARs streben die Projektpartner an, zunächst neue Angriffspunkte auf den Krebszellen des malignen Melanoms zu identifizieren, um im Anschluss gezielt CAR-T-Zellen zu entwickeln, die gegen diese spezifischen Stellen gerichtet sind.

Am Fraunhofer IZI werden mittels moderner Sequenzierungstechnologien (Einzelzell- und räumliche Sequenzierung) hochkomplexe Datensätze erhoben, um mögliche Angriffsstellen zu identifizieren. In Zusammenarbeit mit der Universität Leipzig werden aus diesen Daten, mit Methoden der künstlichen Intelligenz und computergestützter Modellierung, konkrete Angriffsstellen sowie daran bindende Moleküle definiert und optimiert. Am Helmholtz-Zentrum Dresden-Rossendorf werden die dafür spezifischen CAR-T Zellen generiert und anschließend präklinisch getestet.

Partner
Universitätsklinikum Leipzig, Klinik und Poliklinik für Dermatologie, Venerologie und Allergologie; Universität Leipzig, Institut für Wirkstoffentwicklung; Helmholtz Zentrum Dresden Rossendorf, Abteilung Radioimmunologie

Laufzeit
06/2024 – 05/2027

SaxoCell ist ein Konsortium regionaler Forschungseinrichtungen, Kliniken und Unternehmen, die gemeinsam das Ziel verfolgen, in Sachsen ein international wettbewerbsfähiges Forschungs- und Wirtschaftscluster, um das Thema Zell- und Gentherapien zu etablieren. Dafür sollen neuartige Gen- und Zelltherapeutika, sogenannte »lebende Arzneimittel« entwickelt werden. SaxoCell wird im Rahmen des Innovationswettbewerbs »Clusters4Future« vom Bundesministerium für Forschung, Technologie und Raumfahrt gefördert.

In diesem Rahmen unterstützen wir beispielsweise im Projekt »NK Aliance« die Identifikation optimaler Spender für zukünftige CAR-NK-Zelltherapien durch Einzelzellanalysen.

Zusätzlich beraten wir verschieden Arbeitsgruppen bezüglich des experimentellen Designs für die Sequenzierung ihrer Ausgansproben und bieten regelmäßige Informationsveranstaltungen und Workshops zum technischen Hintergrund und Anwendungsoptionen von Einzelzellsequenzierung und Spatial Transcriptomics an. 

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Laufzeit
08/2024 – 07/2027

In Zusammenarbeit mit dem Universitätsklinikum Leipzig und weiteren Partnern untersuchen wir die Eigenschaften therapeutischer CAR-T-Zellen und die Wirkung von CAR-Therapien bei Patient*innen mit Multiplem Myelom.  Wir nutzen Blut- und Gewebeproben von Patient*innen, um die Wirkweise und mögliche Nebenwirkungen der CAR-Therapie auf molekularer Ebene über einen längeren Zeitraum zu beobachten. Dazu wurden bereits Analysen an Patient*innenproben mittels Einzelzellsequenzierungen, Spatial Transcriptomics und Integrationsstellenanalysen durchgeführt.

Die Hämatologie des Universitätsklinikum Leipzig bringt umfangreiche Expertise auf dem Gebiet der Biologie und Therapie des Multiplen Myeloms, sowie Zugriff auf eine umfangreiche Probenbank ein. Während das Fraunhofer IZI die technische Infrastruktur für Mikroskopie, Next-Generation-Sequenzierung und bioinformatische Datenanalyse bereitstellt.

Im Rahmen unserer Kooperationsprojekte im Bereich der Next-Generation-Sequenzierung (NGS) setzen wir modernste Geräte ein, um gemeinsam mit verschiedenen Partnern maßgeschneiderte Sequenzierprotokolle zu entwickeln und umzusetzen. Dafür führen wir umfassende Planungen und Tests durch, um die Protokolle an die spezifischen Anforderungen der jeweiligen Projekte anzupassen. Durch unsere Expertise und technische Ausstattung ermöglichen wir eine effiziente und präzise Umsetzung der Sequenzierverfahren, die für die Forschung und Diagnostik von entscheidender Bedeutung sind.

Langjährige Partnerschaften bestehen unter anderem mit:

• AIM - Advanced Identification Methods GmbH, Leipzig
• Verschieden Institute des Universitätsklinikum Leipzig (u.a. Hämatologie, klinische Immunologie, Dermatologie)
• Leibniz-Institut für Immuntherapie, Regensburg