Next-Generation Diagnostics

10x GENOMICS: Unser Angebot für Forschung sowie präklinische und klinische Anwendungen

© Fraunhofer IZI
Illumina NextSeq 2000
© Fraunhofer IZI

Hochauflösende NGS-Methoden

Einzelzellsequenzierung und Multiomics (10x GENOMICS Workflows):

  • Erstellung von Transkriptomprofilen und parallele Detektion von Oberflächenproteinen auf Einzelzellebene
  • Anwendungsbeispiele: Funktionskontrolle therapeutischer CARs (z.B. CAR-T-Zellen, CAR-NK-Zellen) und Monitoring des Therapieerfolgs in Patient*innen
  • Verfügbare Assays:
    • Chromium GEM-X Single Cell 3' Gene Expression
    • Chromium GEM-X Single Cell 5' Gene Expression
    • Single Cell Immune Profiling
      • Chromium Single Cell V(D)J (T-Zell- und/oder B-Zell Rezeptoranalyse erfolgt in Kombination mit 5' Gene Expressionsanalyse)
      • Expression von Oberflächenproteinen

Räumliche Sequenzierung (Visium Spatial10x GENOMICS):

  • Räumlich aufgelöste Genexpressionsprofile in Geweben bis zur Einzelzellauflösung
  • Anwendungsbeispiel: Parallele molekulare und bildgebende Charakterisierung von Tumor, tumorinfiltrierenden Immunzellen und Tumormikroumgebung
  • Verfügbare Assays:
    • HD Spatial Gene Expression (FFPE-Gewebe)
    • Spatial Gene Expression (FFPE- und Kryogewebe)

Qualitätssicherung

  • ISO 9001 zertifiziertes Qualitätsmanagement-System
  • NGS und Bioinformatik gemäß etablierter SOPs
  • DSGVO-konforme Datenverarbeitung

Verfügbare Ausrüstung / Geräte

  • 10x Genomics Chromium Controller
  • NextSeq 2000, Illumina
  • MiSeq, Illumina
  • MinION, Oxford Nanopore Technologies
  • High Performance Computing Cluster
  • LUNA Automated Cell Counter
  • BioAnalyzer